反渗透在运行中需加入还原剂及反渗透杀菌剂，以防止膜氧化或结垢现象的发生，但是需要严格控制药剂的加药量，反渗透杀菌剂的过量投加反而会导致运行压差上升、产水量下降、脱盐率下降，从而造成反渗透系统运行的不稳定。

　　加入反渗透杀菌剂是为了抵消原水中残余氯影响，防止残余的活性氯氧化膜表面，从而引起膜元件对盐份的脱除能力的下降，但是过量的投加会导致膜表面滋生厌氧菌，形成新的污染物，给膜造成污染，从而导致产水量的下降以及运行差压的上升。

　　反渗透系统随着淡水的不断渗透，其进水侧的盐分将不断被浓缩，当难溶盐浓缩超过其溶解度相应值时，就会在反渗透膜表面发生结垢，若反渗透系统回收率为75%时，其浓水的含盐量就会增加到进水的4倍，回收率越高，产生结垢的风险性就越大。

　　为了防止难溶盐在反渗透膜表面的结垢，在反渗透系统中，通过投加反渗透杀菌剂来有效的防止膜元件结垢，但是当反渗透入口水温降低，产水量降低，此时所需要的阻垢剂加药量也应降低，反渗透杀菌剂是高分子有机物, 大量投加同样也会增加RO运行差压的上升, 给运行带来不利。

　　因此在进行除盐水工艺过程中，要注意反渗透杀菌剂的适量加入，以免造成反效应。